提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
台湾花莲海域发生6.2级地震 全年6级以上地震次数创23年来新高******
中新社台北12月15日电 当地时间15日12时3分，台湾花莲县海域发生一起里氏6.2级地震，震源深度5.7公里。截至当日，台湾今年已发生12起里氏6级以上地震，次数为1999年“九二一”大地震以来新高。
综合中央社、联合新闻网等媒体报道，15日发生的地震位于花莲县东南29.1公里处。地震时一支6人登山队正在攀登玉山主峰，有5人被地震造成的落石砸中，其中两名男子伤势比较严重，其余受伤队员为轻伤。
台湾气象主管部门测报中心主任陈国昌15日表示，2022年台湾共发生12起里氏6级以上的地震，是1999年“九二一”大地震以来发生6级以上地震次数最多的一年。
这位负责人表示，长期来看，台湾平均每年发生约3起里氏6级以上地震、25起里氏5级至6级地震；2022年已发生了61起里氏5级至6级地震，可见今年地震活动比往年活跃很多。(完)
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